分子之间的相互作用对于研究混合物体系的性质至关重要。目前,随着计算机技术的迅速发展,分子动力学和分子对接等理论模拟计算方法已经成为揭示复杂体系的微观结构和分子间相互作用的有效手段。在本论文中,应用分子动力学模拟方法系统研究了抗骨质疏松药物阿仑膦酸及其肝素复合物与骨骼材料羟基磷灰石的相互作用;利用分子对接方法对有机磷多残留检测电化学传感器进行了分子设计和研制。第一章介绍了本论文中用到的分子模拟方法(分子动力学和分子对接)及其应用于阿伦磷酸及其肝素复合物在磷灰石表面的作用模式和有机磷农药多残留检测电化学传感器设计及制备的研究背景。第二章应用分子动力学方法研究了阿仑膦酸、阿仑膦酸-肝素化合物在磷灰石(001)表面的相互作用情况。对分子动力学结果分析发现,复合物由于体系增大,与磷灰石表面的相互作用要比单独阿仑膦酸强;但是连接在肝素末端的阿伦磷酸与羟基磷灰石表面的相互作用反而变弱。第三章研究了阿仑膦酸、阿仑膦酸-肝素化合物与碳酸磷灰石(001)表面的相互作用情况。阿伦磷酸-肝素化合物由于体系增大,与磷灰石表面的相互作用要比单独阿仑膦酸强;当碳酸掺杂羟基磷灰石后,阿仑膦酸、阿仑膦酸-肝素化合物在碳酸磷灰石表面的相互作用能都比在羟基磷灰石(001)表面上的低;化合物中的阿仑膦酸与表面的作用都减弱,而且以连接在肝素末端的阿仑膦酸与表面的相互作用最弱。第四章利用分子模拟方法对传感器进行了设计,分析了与壳聚糖结合的对硫磷小分子的空间取向、关键作用基团和位点;并研究了修饰在壳聚糖上的对硫磷小分子被乙酰胆碱酯酶识别的可能性。因此可通过竞争机制检测待测液中有机磷农残含量。依据此设计方案,课题组进行了有机磷农药多残留电化学传感器研制,实现了对有机磷农药的检测,取得了良好的效果。