背景和目的骨肉瘤是一种恶性程度极高的罕见肿瘤,5年生存率低,转移及复发率高,传统的手术加新辅放化疗无法达到满意的治疗效果。随着测序技术的发展,开始从分子生物学角度解决问题。本文旨在探讨骨肉瘤基因突变类型、生物学功能、通路富集分析等在骨肉瘤发生、发展中的作用,以及TMB与预后的关系,以期进一步指导临床治疗。方法通过骨肉瘤基因组DNA全外显子测序技术,进行突变基因筛选,使用Metascape对改变编码的突变基因进行GO分析、KEGG信号通路富集分析、PPI网络的绘制分析;找寻共有突变并分析其突变类型;做TMB与PFS相关性分析及评价患者预后。结果9例骨肉瘤样本局部间存在大量相同或相关的生物学过程和通路富集,它们在基因表达、肿瘤发展中起关键作用,其中GTP酶活性的调控在8例样本中富集,与骨肉瘤细胞信号的调节、肿瘤的存活与迁移等相关。与骨肉瘤相关的生物学过程及通路富集越多,患者预后越差。筛选后的骨肉瘤驱动基因为体细胞突变,TP53、GNAS、EGFR、BRCA1、RECQL4、RECQL5均在局部样本中的编码区突变,其中TP53、RECQL4、RECQL5突变类型为错义突变。TP53在3例患者中突变,RECQL4、RECQL5分别在1例患者中突变。在相关性分析中,TMB与PFS基本呈负相关(R2=0.8555),在未给予免疫治疗的患者中,TMB越高的骨肉瘤患者预后越差。结论通过基因分析,证实骨肉瘤患者存在普遍而广泛的基因突变,而这些突变基因间相关联且参与肿瘤相关代谢通路。TMB值水平高低可能决定预后及预测疗效,为未来基因靶向或免疫治疗的选择提供参考依据。