由于某些食物可能改变药物的生物利用度，使药物的作用减弱或加强，因此，服抗生素时也要注意选择合适的时间。青霉素类虽然摄入乳制品或膳食纤维可使青霉素的生物利用度降低。但也可增加较高血药浓度的持续时间，而且青霉素耐酸，服后有轻度恶心、呕吐不良反应，饭后服用比空腹服用更佳。进食使氨苄青霉素的生物利用度降低，导致治疗失败，所以宜空腹服用。常规食物或奶制品不影响阿莫西林的生物利用度，故阿莫西林没有饭前或饭后服用的限制。
　　头孢类较大儿童和成年人进食不影响头孢氨苄的生物利用度，饭前饭后服用均可。但婴幼儿用药的同时吃奶会使药物的生物利用度降低，故以空腹给药为宜，吸收率可达90％。
　　大环内酯类琥乙红霉素在进食时服用，虽然生物利用度降低，但在血中浓度仍可保持对大多数病原体的最小抑菌浓度，故饭前或饭后服用均可。红霉素肠衣片和肠衣丸最好空腹时服用，以提高药物的生物利用度。阿奇霉素胶囊与食物一同摄入时。其生物利用度降低，宜饭前1小时或饭后2小时服用，但其片剂或混悬液则不受食物的影响。罗红霉素与食物一同摄入，则使药物吸收减少，故主张饭前服用。
　　喹诺酮类一般食物不影响环丙沙星、诺氟沙星的生物利用率，但乳制品可使生物利用率降低，并可导致治疗失败，所以服用上述两种药物时不要饮用乳制品。氧氟沙星在饭前或饭后服用均可。
　　四环素类乳制品可减少机体对四环素的吸收，即使饮用少量的奶或咖啡都可使其吸收减少50％，造成治疗失败，所以不要一起服用。正常膳食对多西环素的吸收影响不大，乳制品则使其生物利用度降低，但血药浓度仍高于对大多数病原体的最小抑菌浓度，因此对疗效影响也不大，加上多西环素常见恶心、呕吐、腹泻等胃肠道反应，所以宜飯后服用。
　　抗真菌药进食有助于提高伊曲康唑胶囊的生物利用度，宜饭后服用。脂肪含量高的食物有助于灰黄霉素的吸收，空腹用药可导致治疗失败，所以宜饭后服用。
　　抗分枝杆菌药进食可使异烟肼、利福平的生物利用度降低。有可能致治疗失败，宜空腹服药。 　抗病毒药进食可使齐多夫定、拉米夫定吸收延迟，但不影响疗效，所以可饭前也可饭后服用，进食可使沙奎那韦的生物利用度大大增高，而空腹时摄入可能导致治疗失败，所以本品宜饭后服用。