先天免疫系统是一种反应迅速的非特异性机制,在动物应对外来病原体入侵的早期防御中发挥着十分重要作用。急性期反应（Acute phase response,APR）是动物先天免疫的重要组成部分,是生物体面对感染、组织损伤和免疫系统疾病等病理反应时的一种快速反应。急性期蛋白（Acute phase protein,APP）是在APR过程中承担主要免疫任务的一类蛋白质。血清淀粉样蛋白A（Serum amyloid A,SAA）是一种保守的急性期蛋白,常被用作评价动物体内炎症程度的生理指标。在第一部分中,我们以水产养殖品种克氏原螯虾为实验材料,鉴定了其血清淀粉样蛋白PcSAA。PcSAA的氨基酸序列包括典型的信号肽和保守的SAA结构域。在白斑综合征病毒（White spot syndrome virus,WSSV）、革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）和革兰氏阴性菌嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）刺激后,PcSAA的表达水平被显著上调且在24 h时达到峰值。为了进一步研究PcSAA的功能,我们采用了 siRNA进行RNA干扰,敲低该基因的表达,发现螯虾应对病毒和细菌感染的能力显著下降,死亡率显著上升。进一步研究发现,重组表达的rPcSAA能够结合WSSV表面的囊膜蛋白VP28。另外,rPcSAA还可结合细菌表面的多糖,也可以直接结合细菌。我们对螯虾肠道进行组织学分析发现,与对照组相比,抑制PcSAA表达后,细菌及病毒感染的螯虾肠道上皮细胞排列发生紊乱,固有层出现了大量空泡,上皮细胞表面角质层出现脱落。以上结果显示,PcSAA能够响应病毒和细菌刺激,通过结合细菌表面的多糖和病毒表面的囊膜蛋白以帮助机体抵御外界病原体入侵。另外,我们还从日本囊对虾（Marsupenaeus japonicus）中发现了一种应激相关蛋白Turandot,命名为MjTot。这是首次在甲壳动物中鉴定出此类蛋白。我们发现在WSSV刺激后,MjTot的表达水平被显著上调且在48 h时达到峰值。我们同样采用RNA干扰和注射重组蛋白两种手段探究了 MjTot的抗病毒功能。当MjTot的表达被抑制后,对虾体内的病毒含量以及对虾死亡率显著上升;当向对虾体内注射重组蛋白rMjTot后,对虾体内的病毒含量显著降低。我们进一步筛选对虾中的抗脂多糖因子ALFs,发现MjTot能够诱导ALF-C1和ALF-C2上调。最后,我们探究了 MjTot、ALF和Stat之间的关系。得出结论,MjTot可能是通过调节Stat进而调节ALF发挥抗病毒作用的。